Gdyby finansowanie okazało się niezbędne, zarządzający NFI byliby zobowiązani do znalezienia funduszy w instytucjach finan­sowych i na rynku kapitałowym. Ze względu jednak na znaczne opóźnienie programu, sytuacja finansowa wielu przedsiębiorstw po­gorszyła się, zmieniając przez to warunki ich dostępu do kapitału. W związku z tym EBOR w początkowej fazie programu NFI zapewni finansowanie pewnej liczbie przedsiębiorstw, które nie mają dość kapitału na dalszy rozwój, ale mają dobrze przygotowany biznes plan. Finansowanie kapitałowe otrzymają poszczególne przed­siębiorstwa we współpracy z odpowiednimi NFI oraz po zatwier­dzeniu projektu przez Radę Nadzorczą EBOR.